DOUBLE STRANDED DNA VIRUSES

BAB 1

PENDAHULUAN

A. LATAR BELAKANG

Virus DNA adalah virus yang memiliki DNA sebagai materi genetik dan ulangan menggunakan DNA polimerase DNA-dependent. Asam nukleat biasanya DNA beruntai ganda (dsDNA) tetapi mungkin juga DNA beruntai tunggal (ssDNA). Virus DNA milik baik Grup I atau Grup II pada sistem klasifikasi Baltimore virus. DNA beruntai tunggal biasanya diperluas untuk beruntai ganda pada sel yang terinfeksi. Meskipun Grup VII virus seperti hepatitis B mengandung genom DNA, mereka tidak dianggap virus DNA menurut klasifikasi Baltimore, melainkan membalikkan virus menyalin karena mereka meniru melalui perantara RNA.

Salah satu virus yang termasuk dalam Kelas I dari klasifikasi Baltimore sistem ditandai dengan memiliki untai ganda DNA sebagai materi genetik dan menggunakan DNA -dependent DNA polimerase selama replikasi .

Sebagian besar virus harus memasukkan tuan rumah inti sebelum mereka dapat ditiru. Hal ini karena mereka menggunakan sel inang s ' polimerase ketika mereka mereplikasi virus genom . Mereka dapat menginduksi sel untuk menjalani pembelahan sel , yang selanjutnya mengarah ke transformasi dari sel , dan akhirnya, untuk kanker . Contohnya termasuk adenovirus , herpesvirus , poxvirus , dll.

Replikasi DNA adalah proses penggandaan rantai ganda DNA. Pada sel, replikasi DNA terjadi sebelum pembelahan sel. Prokariota terus-menerus melakukan replikasi DNA. Pada eukariota, waktu terjadinya replikasi DNA sangatlah diatur, yaitu pada fase S siklus sel, sebelum mitosis atau meiosis I. Penggandaan tersebut memanfaatkan enzim DNA polimerase yang membantu pembentukan ikatan antara nukleotida-nukleotida penyusun polimer DNA. Proses replikasi DNA dapat pula dilakukan in vitro dalam proses yang disebut reaksi berantai polimerase (PCR).

B. RUMUSAN MASALAH

1. apakah yang dimaksud dengan Grup 1 – Double Stranded DNA Viruses ?

2. Bagaimana proses replikasi Grup 1 – Double Stranded DNA Viruses?

3. Berikan contoh tentang Grup 1 – Double Stranded DNA Viruses?

C. TUJUAN PENULISAN

1. Mengetahui pengertian Grup 1 – Double Stranded DNA Viruses

2. Mengetahui proses replikasi Grup 1 – Double Stranded DNA Viruses

3. Mengetahui contoh virus Grup 1 – Double Stranded DNA Viruses

BAB II

PEMBAHASAN

1. PENGERTIAN GRUP 1 – DOUBLE STRANDED DNA VIRUSES

Virus DNA adalah virus yang memiliki DNA sebagai materi genetik dan ulangan menggunakan DNA polimerase DNA-dependent. Asam nukleat biasanya DNA beruntai ganda (dsDNA) tetapi mungkin juga DNA beruntai tunggal (ssDNA). Virus DNA milik baik Grup I atau Grup II pada sistem klasifikasi Baltimore virus. DNA beruntai tunggal biasanya diperluas untuk beruntai ganda pada sel yang terinfeksi. Meskipun Grup VII virus seperti hepatitis B mengandung genom DNA, mereka tidak dianggap virus DNA menurut klasifikasi Baltimore, melainkan membalikkan virus menyalin karena mereka meniru melalui perantara RNA.

Kelompok I: virus dsDNA          

Organisasi genom dalam kelompok ini sangat bervariasi. Beberapa memiliki genom melingkar (Baculoviridae, Papovaviridae dan Polydnaviridae) sementara yang lain memiliki genom linier (Adenoviridae, Herpesviridae dan beberapa fag). Beberapa keluarga telah sirkuler permutasi genom linier (fag tempat  dan beberapa Iridoviridae). Lain memiliki genom linier dengan ujung kovalen tertutup (Poxviridae dan Phycodnaviridae).  
Sebuah virus menginfeksi archaea pertama kali dijelaskan pada 1974. Beberapa orang lain telah dijelaskan sejak: sebagian besar memiliki kepala-ekor morfologi dan linear double-stranded DNA genom. Morfologi lain juga telah dijelaskan: poros berbentuk, berbentuk batang, berserabut, icosahedral dan bulat. Jenis morfologi tambahan mungkin ada.Pesanan dalam kelompok ini didefinisikan berdasarkan morfologi daripada kesamaan urutan DNA. Diperkirakan bahwa morfologi adalah lebih dihemat dalam kelompok ini dari kesamaan urutan atau urutan gen yang sangat variabel. Tiga perintah dan 33 keluarga saat ini diakui. Empat genera diakui yang belum ditugaskan keluarga. Spesies Sulfolobus yg mempunyai menara virus ikosahedral begitu tidak seperti virus yang telah dijelaskan sebelumnya bahwa itu akan hampir pasti ditempatkan di keluarga baru pada revisi berikutnya dari keluarga virus.       

Lima belas keluarga yang menyelimuti. Ini termasuk semua tiga keluarga di Herpesvirales ketertiban dan keluarga berikut: Ascoviridae, Ampullaviridae, Asfarviridae, Baculoviridae, Fuselloviridae, Globuloviridae, Guttaviridae, Hytrosaviridae, Iridoviridae, Lipothrixviridae, Nimaviridae dan Poxviridae.          

Bakteriofag milik keluarga Tectiviridae dan Corticoviridae memiliki lapisan ganda lipid di dalam kapsid ikosahedral protein dan membran mengelilingi genom. Para Sulfolobus virus crenarchaeal yg mempunyai menara virus ikosahedral memiliki struktur serupa.     Genom dalam kelompok ini sangat bervariasi dari ~ 20 kilobasa untuk lebih dari 1,2 megabases panjangnya inangnya         

Spesies dari Caudovirales ketertiban dan keluarga Corticoviridae dan Tectiviridae menginfeksi bakteri.Spesies dari Ligamenvirales ketertiban dan keluarga Ampullaviridae, Bacilloviridae, Bicaudaviridae, Clavaviridae, Fuselloviridae, Globuloviridae dan Guttaviridae menginfeksi spesies archaea hyperthermophilic dari Crenarchaeota tersebut.Spesies dari Herpesvirales ketertiban dan keluarga Adenoviridae, Asfarviridae, Iridoviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae dan Poxviridae menginfeksi vertebrata.
Spesies dari Ascovirus keluarga, Baculovirus, Hytrosaviridae, Iridoviridae dan Polydnaviruses dan dari Nudivirus genus menginfeksi serangga. 

Spesies dari keluarga Marseilleviridae, Megaviridae dan Mimiviridae dan virophage Mavirus spesies dan virophage Sputnik menginfeksi protozoa.      Spesies dari keluarga Nimaviridae menginfeksi krustasea.Spesies keluarga Phycodnaviridae dan spesies Organik Danau virophage menginfeksi ganggang. Ini adalah dsDNA hanya dikenal virus yang menginfeksi tanaman.Spesies dari Plasmaviridae keluarga menginfeksi spesies dari Mollicutes kelas.Spesies dari genus Dinodnavirus menginfeksi dinoflagellata. Ini adalah virus yang menginfeksi hanya dikenal dinoflagellata.Spesies dari genus Rhizidiovirus menginfeksi stramenopiles. Ini adalah dsDNA hanya dikenal virus yang menginfeksi stramenopiles.Spesies dari genus Salterprovirus menginfeksi spesies archaea halofilik dari Euryarchaeota tersebut.

B.     REPLIKASI DNA VIRUS BERANTAI GANDA          

Siklus replikasi           
1. Adsorpsi-Virus dapat memasuki sel melalui fagositosis, viropexis atau adsorpsi. Adsorpsi adalah proses yang paling umum dan proses yang paling sangat spesifik. Hal ini membutuhkan interaksi dari protein unik pada permukaan virus dengan sangat spesifik reseptor situs pada permukaan sel.            
2. Penetrasi-ini terjadi oleh satu atau lebih proses.    
    Virus terbungkus amplop sekering dengan membran sel inang. Hal ini melibatkan pencernaan lokal dari membran virus dan seluler, fusi membran dan pelepasan seiring nukleokapsid ke dalam sitoplasma.  
    Virus telanjang mengikat situs reseptor pada membran sel, mencerna membran dan masuk ke dalam sitoplasma utuh.   
    Kedua virus telanjang dan diselimuti dapat dicerna oleh sel fagositik. Namun, dalam proses ini mereka memasuki sitoplasma tertutup dalam membran sitoplasma yang berasal dari sel fagositik.       
3. Uncoating-Selama tahap ini enzim proteolitik selular mencerna kapsid jauh dari asam nukleat. Ini selalu terjadi pada sitoplasma sel inang. Periode siklus replikasi antara akhir tahap uncoating dan pematangan partikel virus baru disebut gerhana. Dengan demikian selama tahap gerhana, ada partikel virus yang lengkap dapat dilihat dalam sel.            
4. Replikasi asam nukleat. Replikasi asam nukleat virus adalah proses yang kompleks dan variabel. Proses tertentu tergantung pada jenis asam nukleat.

     Replikasi DNA-virus pengecualian dari poxvirus, semua virus DNA bereplikasi dalam nukleus. Dalam beberapa kasus salah satu untai DNA ditranskripsi (pada orang lain kedua untai bagian kecil dari DNA dapat ditranskripsi) (langkah 4) menjadi mRNA spesifik, yang pada gilirannya diterjemahkan (langkah 5) untuk mensintesis protein spesifik virus seperti sebagai antigen tumor dan enzim yang diperlukan untuk biosintesis DNA virus. Periode ini meliputi fungsi virus awal. Sel inang sintesis DNA untuk sementara meningkat dan kemudian ditekan sebagai sel bergeser ke pembuatan DNA virus (langkah 6). Sebagai DNA virus terus menjadi ditranskripsi, fungsi virus akhir menjadi jelas. Messenger RNA ditranskripsi selama fase selanjutnya dari infeksi (langkah 6) berpindah ke sitoplasma dan diterjemahkan (langkah 7). Protein untuk capsids virus disintesis dan diangkut ke inti yang akan dimasukkan ke dalam virion lengkap (langkah 8). Majelis subunit protein sekitar hasil DNA virus dalam pembentukan virion lengkap (langkah 9), yang dirilis setelah lisis sel.         

     Single-stranded DNA virus pertama membentuk DNA beruntai ganda, memanfaatkan sejumlah DNA-dependent DNA polimerase. Mereka kemudian menjalani siklus replikasi khas.

C.    CONTOH VIRUS DNA

1.      cacar (variola) 

2.      vaccinia (digunakan untuk mengimunisasi terhadap cacar sampai penyakit itu tereliminasi dari planet ini

3.      varicella-zoster (penyebab cacar air pertama kalinya; herpes zoster kedua)

4.      herpesvirus, herpes simplex virus o    
 a. HSV-1 - biasanya menginfeksi saraf trigeminal berkala menyebabkan "luka dingin" di bibir dan wajah

b.      HSV-2 - biasanya menginfeksi daerah genital      

5.      KSHV; menyebabkan sarkoma Kaposi pada pasien AIDS dan orang lain dengan sistem kekebalan ditekan. Juga disebut virus herpes manusia 8 (HHV-8).

6.      cytomegalovirus manusia (HCMV); kebanyakan dari kita memilikinya, dapat menyebabkan kebutaan - bahkan kematian - pada orang dengan sistem kekebalan ditekan.

7.      Epstein-Barr (EBV); menyebabkan mononucleosis dan telah terlibat dalam pengembangan limfoma Burkitt (kanker) dan penyakit Hodgkin. Genom telah sepenuhnya diurutkan: pasangan basa DNA 172.282 encoding 80 gen.

8.      adenovirus; sekitar 50 jenis menginfeksi manusia; bertanggung jawab atas beberapa kasus yang umum "dingin". Dua strain telah dimodifikasi untuk melayani sebagai vektor dalam uji terapi gen Bagaimana virus herpes (HSV, CMV, dan EBV) dan adenovirus menghindari respon kekebalan dari tuan rumah mereka.

9.      SV40, sebuah virus yang menginfeksi sel primata dan tumor penyebab dalam sel tikus.

Beberapa bakteriofag 
1. T2 dan T4, dari informasi awal yang banyak tentang struktur gen dan ekspresi yang telah dipelajari.

2.      lambda; vektor populer    

ü  Unsur-unsur penting dari siklus infektif bakteriofag DNA terdiri dari:
Para virion melekat pada permukaan sel inang mereka (a).

ü  Protein dari kapsid menyuntikkan inti DNA ke dalam sel (b).

ü  Setelah di dalam sel, beberapa gen bakteriofag (yang "awal" gen) ditranskripsi (oleh RNA polimerase inang) dan diterjemahkan (oleh ribosom tuan rumah, tRNA, dll) untuk memproduksi enzim yang akan membuat banyak salinan fag DNA dan akan mematikan (bahkan menghancurkan) DNA inang.

ü  Sebagai salinan segar DNA fag menumpuk, gen lain (yang "terlambat" gen) ditranskripsi dan diterjemahkan untuk membentuk protein kapsid (c).

ü  Para persediaan inti DNA dan protein kapsid dirakit menjadi virion lengkap (d).

ü  Lain "terlambat" gen ditranskripsi dan diterjemahkan ke dalam molekul lisozim. Lisozim menyerang dinding peptidoglikan (dari dalam, tentu saja).
Link ke deskripsi ilustrasi aksi lisozim pada dinding sel bakteri.

ü  Akhirnya pecah sel dan melepaskan isinya dari virion siap untuk menyebarkan infeksi ke sel tempat baru

Hepatitis B     
Genom hepatitis B ("serum hepatitis") juga dsDNA, tetapi modenya replikasi berbeda dengan virus dsDNA lainnya.           

v  Setelah di dalam sel inang (sel hati), inti virion memasuki inti.

v  DNA virus ditranskripsi (oleh host RNAP II) menjadi molekul mRNA.
Ini memasuki sitoplasma di mana mereka dijabarkan (lagi oleh ribosom host, dll) ke dalam berbagai protein dari virus, termasuk reverse transcriptase virus.
Komponen ini dirakit menjadi core virus baru, dan di setiap satu molekul mRNA terbalik ditranskripsi menjadi untai tunggal DNA, yang kemudian berfungsi sebagai template untuk sintesis untai kedua.        

BAB III

PENUTUP

A.    KESIMPULAN

Virus DNA adalah virus yang memiliki DNA sebagai materi genetik dan ulangan menggunakan DNA polimerase DNA-dependent.

Organisasi genom dalam kelompok ini sangat bervariasi. Beberapa memiliki genom melingkar (Baculoviridae, Papovaviridae dan Polydnaviridae) sementara yang lain memiliki genom linier (Adenoviridae, Herpesviridae dan beberapa fag).

B.     SARAN

Mahasiswa menyadari akan kekurangan mencari data yang factual maka dari itu, kami membutuhkan referensi yang jelas tentang makalah ini.

  

DAFTAR PUSTAKA

Anonim. 2010http://www.google.co.id/images?q=virus&rls=com.microsoft:en-S:{referrer:source%3F}&oe=UTF&rlz=1I7ADSA_en&um=1&ie=UTF&source=og&sa=N&hl=id&tab=wi&biw=1280&bih=610 (7/10/2010)

http://id.wikipedia.com/

http://google.com